Enquanto as obras para construção do Aquário do Pantanal estão em andamento, pesquisadores já iniciaram trabalho para definir como serão os estudos desenvolvidos com as espécies de fauna e flora disponibilizadas na nova estrutura. Serão seis laboratórios para pesquisa no Centro de Desenvolvimento da Ictiofauna Pantaneira, nome oficial do Aquário, previsto para ficar pronto em julho de 2013, além de biblioteca e espaço para passeio didático.
O Aquário, que está sendo construído no Parque das Nações Indígenas, não deve ser visto apenas como um complexo turístico, mas como um avanço para a área de pesquisa no Estado, segundo o secretário estadual de Meio Ambiente, Planejamento, Ciência e Tecnologia, Carlos Alberto Negreiros.
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