Estudos da Organização Mundial da Saúde indicam que há mais casos de microcefalia do que os divulgados pelo Ministério da Saúde no Brasil.
Dados oficiais mostram que até 2014 a incidência era de 0,5 caso para cada 10 mil nascimentos; média de 150 ao ano. No entanto, de janeiro para cá foram confirmados 462 casos de microcefalia e 3,85 mil ocorrência em investigação.