A Zona de Alta Vigilância (ZAV) em Mato Grosso do Sul começa a vacinação contra aftosa dos animais de 0 a 12 meses em fevereiro. Todo o rebanho bovino e bubalino, na ZAV, será vacinado no mês de junho e de 20 de novembro a 20 de dezembro deste ano.
Para as outras áreas, a vacinação dos animais com idade abaixo de 24 meses acontece em maio. E em novembro é feita a vacinação de todo o rebanho.
Também no Estado, os proprietários de bovinos ou bubalinos localizados em fazendas pantaneiras têm a opção de vacinar todo o rebanho ou em maio/junho ou em novembro/dezembro.