O ataque gerou uma crise diplomática entre Israel e Turquia, além de protestos de vários países, inclusive do Brasil. "Estou convencido de que no fim da investigação, ficará claro que o Estado de Israel e as IDF [sigla em inglês para as Forças de Defesa Israelenses] agiram de acordo com as leis internacionais", disse Netanyahu.
A comissão de inquérito foi criada em meio a intensa pressão internacional para que fosse investigado o caso. Alguns observadores, entretanto, afirmam que a comissão dificilmente conseguirá responder o porquê de a operação ter terminado desta forma.
Netanyahu não terá que defender a política israelense em relação a Gaza diante da comissão e parte de seu depoimento poderá ser feita de forma privada. O ministro da Defesa israelense e o chefe do Exército também deverão prestar depoimento ainda nesta semana. Observadores afirmam que os próximos inquéritos internacionais sobre o tema poderão ser mais analíticos e críticos sobre a política do governo israelense no território.
No dia do ataque, autoridades israelenses alegaram que os ativistas estavam determinados a atacar os soldados que participavam da ação militar. Autoridades turcas descreveram a ação como "terrorismo de Estado".
Sob críticas da comunidade internacional, nos últimos meses, o governo de Israel reduziu o bloqueio à Faixa de Gaza ao autorizar a entrada de certos tipos de alimentos e alguns bens de consumo. Mas mantém as restrições a produtos considerados úteis na fabricação de armamentos, o que inclui material de construção.
