A organização dos serviços de saúde cabe aos municípios e a responsabilidade de contratar médicos não é do governo federal. Baseado nesta afirmação, o ministro da Saúde, Ricardo Barros, disse que o Programa Mais Médicos é provisório e que, ao longo do tempo, profissionais estrangeiros poderão ser substituídos por brasileiros.
Em 2,5 mil municípios brasileiros, o atendimento à população é feito exclusivamente com profissionais do Mais Médicos. Atualmente, o programa federal integra 18,240 mil médicos (29% brasileiros, 63% cubanos e 8% intercambistas individuais) com pagamento mensal de uma bolsa de R$ 10 mil.